朽菌核危害幼苗和鳞茎，碎色花瓣病危害花朵和茎线虫病危害地上部。鳞茎收藏时，剔除受伤或有病鳞茎，贮藏鳞茎时室内要通风。风信子的病害防治应以加强管理为基础、采取积极预防、综合防治为原则。由于风信子在温室中生长期较短，以发生病害为主。风信子常见的病害有生芽腐烂，软腐病、菌核病和病毒病。种植前基质严格消毒，种球清选并作消毒处理，生长期间每7d喷一次1000倍退菌特或百菌清，交替使用，可以在一定程度上抑制病菌的传播。严格控制浇水量，加强通风管理，控制环境中空气相对湿度，出现中心病株及时拔除，可以大幅度降低发病率。
灰霉病
发病初期，感病叶尖变色，叶片皱缩腐烂。冷湿条件下，花部亦发生腐烂。发病后期，病部产生灰色霉层及黑色菌核。病原菌以菌核在病残体及土壤中越冬，条件适宜时产生分生孢子，分生孢子随风雨传播进行侵染危害。低温高湿利于病害发生。
防治方法
减少侵染来源：及时摘除病花、病叶，集中销毁。
药剂防治：发病初期，喷施1：1：100波尔多液，或65％代森锌可湿性粉剂500～800倍液，或50％苯来特可湿性粉剂1000倍液，或斑锈清800～1000倍液喷雾防治。
根瘤病
风信子根肿病又称根瘤病。根系初发生时正常，伸长至～定程度即产生白色小瘤体，长势减弱，有时发生小花干腐，影响生长发育，严重时全株桔死。
防治方法：
（1）贮藏期严格消毒灭菌，注意加强通风，勤检查，勤翻动，发现病株及时捡出集中烧毁。
（2）严格进行土壤消毒灭菌，不连作，不重复应用栽培土。
（3）栽培期间发现病株及时清除，并对土壤进行灭虫灭菌。
（4）严格检疫，不使病球病株八圃。
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